З метою недопущення корупційних правопорушень, а також злочинності у сфері службової діяльності, працівниками відділу внутрішньої безпеки (ВВБ) ГУ ДФС у Чернігівській області проводиться профілактична робота та упереджувальні заходи. Показники роботи в напрямку протидії корупції висвітлюються в засобах масової інформації.
З метою зниження рівня корупції у податковій та митній сфері протягом 2016 року працівниками ВВБ ГУ ДФС у Чернігівській області проведено 88 службових розслідувань та перевірок, за результатами яких 16 матеріалів спрямовано до правоохоронних органів для прийняття рішення.
За матеріалами працівників ВВБ органами прокуратури відкрито 9 кримінальних проваджень за фактами скоєння службових злочинів стосовно працівників податкової та митної служби, з яких за фактом вимагання та отримання неправомірної вигоди – 3 кримінальні провадження, за фактом вимагання неправомірної вигоди за здійснення впливу на службових осіб правоохоронних органів – 1, за фактом зловживання службовим становищем – 2, за фактом неналежного виконання службових обов’язків – 2, за фактом несанкціонованих дій з інформацією, яка оброблюється в електронно-обчислювальних машинах – 1.
 
На адресу керівництва Чернігівської митниці ДФС та територіальних органів ДФС у Чернігівській області направлено 48 подань про вжиття заходів реагування за фактами виявлених працівниками ВВБ порушень, за результатами розгляду яких 8 працівників звільнено з органів ДФС, притягнуто до дисциплінарної відповідальності 28 посадовців, винесено офіційних застережень – 21.